استقبل المستشفى أكثر من 175 شهيد خلال انتفاضة الأقصى وما تلاها من الاحداث حيث تعرض المستشفى للعديد من الاعتداءات التي كان اخرها اقتحام المستشفى من قبل قوه كبيره من المستعربين تمخض عنها اختطاف احد المصابين واستشهاد مرافقه في عمليه استهجنت من قبل العالم اجمع
عالج المستشفى أكثر من 4800 جريح في انتفاضة الأقصى
ما زال الاحتلال الإسرائيلي جاثماً على الأرض الفلسطينية، ويتحكم في حياة الفلسطينيين، ويسيطـر علــى المعابـر ومصـــادر المياه والاقتصاد، الأمر الذي انعكس بشكل مباشر على الخدمات التي يقدمها المستشفى للمواطنين الصامدين على أرض فلسطين، وبالرغم من ذلك لا زال المستشفى الأهلي يقوم بواجبه خير قيام تجاه الجرحى وأسر المعتقلين والشهداء والفئات الضعيفة في المجتمع الفلسطيني، فسياسة المستشفى تتمثل في علاج جميع ضحايا الاحتلال دون مقابل، وهذا أقل ما نقدمه تجاه من يبذل الغالي والنفيس في سبيل قضيتنا العادلة.
