يعد قسم الطب النووي من الاقسام المميزة بالمستشفى ، وهو القسم الوحيد المرخص بفلسطين الذي يقدم خدمات تشخيصية وعلاجية ضمن المعايير الدولية باستخدام النظائر والمواد المشعة مثل اليود المشع والتكنيشيوم وبخاصّةٍ لمرضى الأورام.
يضم القسم جهازين الاول الجاما كاميرا وهو الجهاز الذي يقدم خدمات تشخصية وعلاجية لأمراض الكلى والقلب والكبد والدماغ وايضا العلاج بالأشعة لأمراض الغدة الدرقية
والثاني هو التصوير الطبقي البزتروني وهو الجهاز الذي نستطيع من خلاله تشخيص الاورام صغيرة الحجم والتي لا يمكن لأي جهاز اخر ان يقوم بتشخيصها ورؤيتها وكذلك تشخيص الاورام المنشرة بالجسم
يضم ايضا القسم 4 غرف عزل مجهزة حسب متطلبات وزارة الصحة الفلسطينية والمعايير الدولية ، هذه الغرف معزولة ضد الرصاص بشكل كامل ويبقى المريض بها لمدة 3 ايام بعد اخذ الجرعات بالمواد المشعة